Kisah shotacon biasanya dilancarkan dalam antologi separa bulanan. Kadang kala, artis manga akan menerbitkan jilid manga individu. Banyak kisah shotacon diterbitkan sebagai dōjinshi; Shotaket (ショタケット),[nb 1] konvensyen tahunan untuk menjual bahan doujin shotacon, ditubuhkan pada tahun 1995,[5] oleh sekumpulan pencipta lelaki.[3] Shotaket 2008 mempunyai lebih daripada 1000 peserta dan menawarkan kerja dari hampir 200 kalangan.[5]

Shotacon untuk wanita adalah hampir secara eksklusifnya yaoi, dan mungkin diterbitkan di majalah antologi yaoi umum atau di salah satu dari beberapa antologi eksklusif shotacon yaoi, seperti Shōnen Romance. Oleh kerana kemungkinan masalah undang-undang, penerbit yaoi AS telah mengelakkan bahan yang menggambarkan watak-watak di bawah umur.[6] Pada tahun 2006, Juné mengeluarkan terjemahan bahasa Inggeris untuk Naichaisouyo (泣いちゃいそうよ) oleh Mako Takahashi di bawah tajuk "Almost Crying",[7] manga shotacon bukan erotik; buku ini mengandungi beberapa kisah yang memaparkan watak lelaki yang sudah dewasa, tetapi hubungan mereka tidak bersifat seksual.

Shotacon untuk pembaca lelaki mungkin mempunyai hubungan homoseksual atau heteroseksual.[nb 2] Kedua-dua lelaki gay dan lurus biasanya melibatkan pelarian antara lelaki yang lebih kecil, sering remaja dan dewasa muda (tokoh kakak / kakak), tokoh berwibawa (guru / bos), tokoh "pakcik / makcik" yang lebih tua (kenalan kejiranan, ahli keluarga sebenar), atau tokoh ayah atau ibu secara langsung (anak angkat, langkah, atau pertalian darah penuh).Di luar kawasan ini, cerita yang hanya melibatkan remaja lelaki (tanpa watak yang lebih tua) tidak jarang berlaku, dengan tema berulang yang paling biasa adalah hubungan rakan sekelas.

Kisah-kisah shota dapat diterbitkan dalam (subset) umum seijin (antologi manga pornografi lelaki) atau dalam beberapa antologi manga shota seijin, seperti Shōnen Ai no Bigaku, yang pakar dalam cerita lelaki-lelaki. Beberapa majalah lelaki gay yang menawarkan campuran bahan pornografi yang sangat luas kadang-kadang menjalankan cerita atau manga yang memaparkan watak peranakan.[8]